论文查重系统对化学公式的处理方式主要取决于公式的呈现形式。根据多数高校和期刊的反馈，化学公式是否计入重复率需要根据具体情况判断。
如果是通过图片形式插入的化学公式(如截图或手写公式拍照)，查重系统目前无法识别图片中的文字和符号。这类公式会被当作空白区域处理，不参与重复率计算。但需要注意的是，如果插入的图片与其他文献中的公式图片完全一致，可能会触发系统对“重复图片”的预警提示。这种情况虽不计入文字重复率，但可能在人工审核时被发现。
如果是用公式编辑器(如 Mathtype、LaTeX 等)直接输入的化学式，系统会将其解析为特殊符号组合。例如，H₂O 这样的分子式，系统会识别其中的数字下标和字母组合。如果完全照搬他人文献中的表达形式，确实会被计入重复率。特别是当多个相同化学式连续排列时(如反应方程式)，更容易被判定为重复内容。
对于常见的基础化学式(如 H₂SO₄、NaOH)，由于属于学科常识范畴，系统会有一定的识别容差。但如果是复杂化合物或特殊反应式(如药物分子式、专利配方中的合成路径)，系统会严格按照字符匹配来计算重复。例如，某篇论文中独创的催化剂配比方程式，若被直接复制使用，查重时会被完整标红。
建议作者在使用化学公式时注意以下三点：首先，对必须引用的他人研究成果，应在公式后标注文献来源;其次，可以适当调整公式的排版格式，比如改变上下标位置(如将 Fe³⁺改为 Fe^3+)，或拆分复杂公式为分步表达式;最后，实验流程中的专属反应式建议配合文字说明，用“首先发生 A 反应生成 B，随后 B 与 C 结合”的描述来降低公式的孤立重复风险。
需要特别注意的是，近年来部分高校升级了查重系统，新增了对 ChemDraw 等专业软件生成式子的识别功能。这类文件虽然以矢量图形式存在，但系统会通过结构式识别技术比对分子式的拓扑结构。因此，直接复制化学结构式也存在潜在风险，建议对环状结构、取代基位置等细节进行适当修改。
化学公式在查重中的处理具有特殊性。既要遵守学术规范，又要合理运用技术手段。最稳妥的做法是：对通用公式保持规范书写，对特色公式进行必要改写，对核心创新公式做好原创声明。同时注意公式与正文的逻辑衔接，通过增加原理阐释来降低单纯公式重复的概率，这比单纯调整公式形式更能有效通过查重审核。
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