论文查重是否需要上传目录，得看具体查重系统的要求。下面用通俗的话来说说：
一、查重系统的基本逻辑
大多数查重系统会把上传的整篇文档都检测一遍，包括封面、目录、正文和参考文献。目录作为论文结构的一部分，通常也会被扫描。不过，目录里的标题会不会被算重复，主要看两点：一是这些标题在数据库里有没有完全一样的;二是系统有没有设置排除目录的功能。
二、目录本身重复的可能性
如果目录是按照学校模板或学术规范写的，这些标题属于通用格式，就算被标红，对整体重复率影响也不大。但要注意：
如果目录里的小标题是直接从别人论文里抄来的，而且这些标题在其他文献里也出现过，那可能会被判定为重复。
有些系统会把目录里的页码(比如“第5页”)或格式符号(比如“……”)也算进去，建议上传前把这些删掉。
三、是否需要主动删除目录
一般情况下不用专门删目录，但有几种情况需要注意：
如果学校明确说“只查正文”，那就按要求来，只上传正文部分。
如果你自查的重复率接近学校的临界值(比如学校要求10%以内，你查出来11%)，可以试试删了目录再查，看看是不是目录导致重复率高。
如果目录是自动生成的，可能会有隐藏的格式代码，上传后系统可能会识别成乱码，建议把目录转成纯文本再上传。
四、实用建议
先看系统说明：在查重平台的提交页面，仔细看看有没有“检测范围”的提示，有些系统会明确说“目录不参与检测”。
问问导师或学长：不同学校对目录查重的要求可能不一样，直接问问有经验的人更靠谱。
自查时保留目录：第一次查重建议把目录也上传，这样能发现标题有没有问题;定稿前如果重复率有点高，可以试试删了目录再查。
手动简化目录格式：别用太花哨的排版(比如艺术字、复杂符号)，用简单的“第一章”“一、”这样的格式，减少误判的风险。
目录要不要上传，主要看学校的规定和查重系统的设置。一般情况下保留目录比较好，这样论文看起来更完整。但如果对重复率要求特别严格，可以灵活处理。最直接的办法就是用同一篇论文，分别带目录和不带目录各查一次，对比结果，看差异在哪。
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